يسعى مشروع الوقف الصحي إلى إدارة جميع المراكز الصحية والعيادات والمستشفيات والإشراف الكامل عليها. حيث يعود ريع هذه المراكز والمرافق الصحية لصالح علاج الحالات المرضية للمرضى المحتاجين ذوي الدخل المحدود والأسر المتعففة وذوي الإحتياجات الخاصة.